噴霧干燥機設備在連續實驗或生產使用一段時間后，需要進行保養和維護。如果不保養或維護，會造成一些配件的損壞或污染。例如干燥塔：如果不進行維護和清潔，內壁就會被弄臟。滿是上次用過的料和臟物，導致干料有雜質。
噴霧干燥機離心霧化器要求高速穩定工作，因此安裝時要保證塔頂安裝霧化器的法蘭面保持水平，并在其間加橡膠法蘭墊。兩個法蘭面確保防震。應特別注意維護。
開機后要注意油泵供油是否正常。如發現油泵不供油，應立即停機，修理或更換油泵。供油正常后方可使用。在操作過程中，操作人員須隨時檢查和注意油泵的供油情況。
工作氣源應保持干燥清潔。用戶應在氣源與霧化器之間配置氣源過濾器和減壓閥，可優先使用過濾減壓閥。
使用過程中如發現異常聲音或劇烈振動，應立即停機檢查原因，待正常后方可使用。
為延長使用壽命，建議在實際操作時將兩個霧化器交替使用。一般霧化器連續工作一段時間后，需要將霧化盤、料液分配盤、導流軸等部件拆下清洗。
導軸承若有輕微劃傷，可用細砂布打磨。如果磨損嚴重，應更換新軸承。當連續使用時間較長時，可加裝水箱冷卻，適當延長使用壽命。